根据《安全生产行政处罚自由裁量适用规则》第十条关于“生产经营单位及其有关人员违反不同的法律规定，或者违反同一条款的不同违法情形，有两个以上应当给予行政处罚的违法行为的，应当适用不同的法律规定或者同一法律条款规定的不同违法情形，分别裁量，合并处罚。”的规定，决定对开化方元硅业有限公司的上述违法行为，分别裁量，合并处罚，决定对开化方元硅业有限公司处贰万伍仟元（￥25000.00）罚款的行政处罚。

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